MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009051	GTT	2	6	21362	21367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126177979
502	NC_009051	GAA	2	6	21421	21426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
503	NC_009051	AAG	2	6	21513	21518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
504	NC_009051	CGA	2	6	21564	21569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
505	NC_009051	TCCT	2	8	21573	21580	0 %	50 %	0 %	50 %	126177980
506	NC_009051	GAC	2	6	21589	21594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
507	NC_009051	GAT	2	6	21610	21615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
508	NC_009051	TGA	2	6	21642	21647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
509	NC_009051	GAT	2	6	21658	21663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
510	NC_009051	CAC	2	6	21667	21672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177980
511	NC_009051	CCT	2	6	21708	21713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177980
512	NC_009051	GAG	2	6	21727	21732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
513	NC_009051	AG	3	6	21762	21767	50 %	0 %	50 %	0 %	126177980
514	NC_009051	CGG	2	6	21781	21786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177980
515	NC_009051	AG	3	6	21820	21825	50 %	0 %	50 %	0 %	126177980
516	NC_009051	AGA	2	6	21840	21845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
517	NC_009051	GAT	2	6	21922	21927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
518	NC_009051	C	6	6	21928	21933	0 %	0 %	0 %	100 %	126177980
519	NC_009051	GAGGAC	2	12	21934	21945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126177980
520	NC_009051	CCGA	2	8	21970	21977	25 %	0 %	25 %	50 %	126177980
521	NC_009051	GAA	3	9	22009	22017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
522	NC_009051	GAG	2	6	22051	22056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
523	NC_009051	CGG	2	6	22086	22091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177980
524	NC_009051	TCC	2	6	22165	22170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177980
525	NC_009051	CGC	2	6	22183	22188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177980
526	NC_009051	GAC	2	6	22216	22221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
527	NC_009051	AGG	2	6	22254	22259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
528	NC_009051	GGA	3	9	22260	22268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
529	NC_009051	GAC	2	6	22298	22303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
530	NC_009051	CCG	2	6	22307	22312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177980
531	NC_009051	GAT	2	6	22333	22338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
532	NC_009051	CAT	2	6	22366	22371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177980
533	NC_009051	GAA	2	6	22381	22386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
534	NC_009051	GAA	3	9	22393	22401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
535	NC_009051	GAG	2	6	22414	22419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
536	NC_009051	GAA	2	6	22931	22936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177981
537	NC_009051	GAA	2	6	23025	23030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177981
538	NC_009051	CTG	2	6	23032	23037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
539	NC_009051	ACA	2	6	23065	23070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126177981
540	NC_009051	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177981
541	NC_009051	CTG	2	6	23114	23119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
542	NC_009051	GCG	2	6	23127	23132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177981
543	NC_009051	GTC	2	6	23166	23171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
544	NC_009051	GCA	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177981
545	NC_009051	CGT	2	6	23210	23215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
546	NC_009051	CAC	2	6	23228	23233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177981
547	NC_009051	GGA	2	6	23267	23272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177981
548	NC_009051	TTA	2	6	23309	23314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126177981
549	NC_009051	AGC	2	6	23342	23347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177981
550	NC_009051	GAG	2	6	23439	23444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177981
551	NC_009051	CG	3	6	23483	23488	0 %	0 %	50 %	50 %	126177981
552	NC_009051	ATG	2	6	23544	23549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177981
553	NC_009051	ACT	2	6	23731	23736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177981
554	NC_009051	CCGG	2	8	23742	23749	0 %	0 %	50 %	50 %	126177981
555	NC_009051	CGG	2	6	23785	23790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177981
556	NC_009051	TGG	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177981
557	NC_009051	AAG	2	6	23934	23939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177981
558	NC_009051	CTACGA	2	12	23954	23965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126177981
559	NC_009051	AGG	2	6	23977	23982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177981
560	NC_009051	AG	3	6	23984	23989	50 %	0 %	50 %	0 %	126177981
561	NC_009051	TCC	2	6	23992	23997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177981
562	NC_009051	AGAC	2	8	24038	24045	50 %	0 %	25 %	25 %	126177982
563	NC_009051	CGG	2	6	24069	24074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177982
564	NC_009051	ACG	2	6	24195	24200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177982
565	NC_009051	AT	3	6	24265	24270	50 %	50 %	0 %	0 %	126177982
566	NC_009051	GT	3	6	24287	24292	0 %	50 %	50 %	0 %	126177982
567	NC_009051	GAA	2	6	24311	24316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177982
568	NC_009051	CGC	2	6	24361	24366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177982
569	NC_009051	CGT	2	6	24505	24510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177982
570	NC_009051	GAG	2	6	24711	24716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177982
571	NC_009051	TCG	2	6	24723	24728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177982
572	NC_009051	TCA	2	6	24753	24758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177982
573	NC_009051	CCT	2	6	24769	24774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177982
574	NC_009051	GACG	2	8	24796	24803	25 %	0 %	50 %	25 %	126177982
575	NC_009051	TGG	2	6	24835	24840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177982
576	NC_009051	TCT	2	6	24861	24866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126177982
577	NC_009051	C	6	6	25008	25013	0 %	0 %	0 %	100 %	126177982
578	NC_009051	CGA	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177982
579	NC_009051	GGC	2	6	25061	25066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177982
580	NC_009051	CTC	2	6	25090	25095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177982
581	NC_009051	CGGGC	2	10	25114	25123	0 %	0 %	60 %	40 %	126177982
582	NC_009051	ACAGT	2	10	25145	25154	40 %	20 %	20 %	20 %	126177983
583	NC_009051	GGAT	2	8	25199	25206	25 %	25 %	50 %	0 %	126177983
584	NC_009051	CG	3	6	25222	25227	0 %	0 %	50 %	50 %	126177983
585	NC_009051	CTG	2	6	25317	25322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177983
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587	NC_009051	GTC	2	6	25555	25560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177983
588	NC_009051	CGA	2	6	25647	25652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177983
589	NC_009051	GAG	2	6	25675	25680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177983
590	NC_009051	TCA	2	6	25715	25720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177983
591	NC_009051	CAC	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177983
592	NC_009051	ACC	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177983
593	NC_009051	CCGG	2	8	25770	25777	0 %	0 %	50 %	50 %	126177983
594	NC_009051	GGT	2	6	25785	25790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177983
595	NC_009051	TCC	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177983
596	NC_009051	CT	3	6	25826	25831	0 %	50 %	0 %	50 %	126177983
597	NC_009051	CG	3	6	25835	25840	0 %	0 %	50 %	50 %	126177983
598	NC_009051	TCG	2	6	25850	25855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177983
599	NC_009051	GACC	2	8	25869	25876	25 %	0 %	25 %	50 %	126177983
600	NC_009051	CTG	2	6	25885	25890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177983
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603	NC_009051	CTG	2	6	26021	26026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177984
604	NC_009051	GCACA	2	10	26037	26046	40 %	0 %	20 %	40 %	126177984
605	NC_009051	GAC	2	6	26061	26066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177984
606	NC_009051	GGA	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177984
607	NC_009051	CTCC	2	8	26231	26238	0 %	25 %	0 %	75 %	126177984
608	NC_009051	CCGGG	2	10	26246	26255	0 %	0 %	60 %	40 %	126177984
609	NC_009051	CGA	2	6	26281	26286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177984
610	NC_009051	ACC	2	6	26296	26301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177984
611	NC_009051	TGG	2	6	26355	26360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177984
612	NC_009051	GAT	2	6	26456	26461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177984
613	NC_009051	TCG	2	6	26497	26502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177984
614	NC_009051	AGC	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177984
615	NC_009051	AG	3	6	26798	26803	50 %	0 %	50 %	0 %	126177984
616	NC_009051	ATG	2	6	26814	26819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177984
617	NC_009051	GTCTG	2	10	26820	26829	0 %	40 %	40 %	20 %	126177984
618	NC_009051	ATG	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177985
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620	NC_009051	ACA	2	6	27312	27317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126177985
621	NC_009051	GTC	3	9	27345	27353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177985
622	NC_009051	GAA	2	6	27356	27361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177985
623	NC_009051	G	7	7	27428	27434	0 %	0 %	100 %	0 %	126177985
624	NC_009051	TCAT	2	8	27459	27466	25 %	50 %	0 %	25 %	126177985
625	NC_009051	AGG	2	6	27470	27475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177985
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